Les voyages sont formellement déconseillés dans plusieurs régions de ce pays : Mindanao, Palawan, Basilan, Tawi-Tawi, Sulu
A la suite des attentats de Bali du 12 octobre 2002 qui ont visé des touristes occidentaux, il est rappelé que le risque d'actes terroristes international ne peut être exclu dans cette région d'Asie du Sud-Est.
Il convient donc d'exercer la plus grande vigilance dans les lieux publics, particulièrement les restaurants, cinémas, places touristiques, malls et grands magasins, éventuellement les lieux de culte connus pour être fréquentés par des étrangers.